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本リストは，吉田・吉永 (2010) を基に北山・鈴木が改変したものです (2015.3.31)。主な変更点は番号をつけ，リストのあとに列記しました。吉田・鈴木・吉永 (2015) を参考に修正を行いました (2017.12.24)。
＊1 Siemer et al. (1998)，Rouseau & Reviers (1999)，Reviers et al. (2007)，Phillips et al. (2008) などに従い，ナガマツモ目（Chordariales），ウイキョウモ目（Dictyosiphonales），カヤモノリ目（Scytosiphonales）をシオミドロ目(Ectocarpales)に含めました。
＊2 Peters & Ramirez (2001) に従い，ピラエラ科（Pilayellaceae）をアキネトスポラ科に含みました。アキネトスポラ属（Acinetospora），フェルドマニア属（Feldmannia），ヒンクシア属（Hincksia）をシオミドロ科（Ectocarpaceae）からアキネトスポラ科に移しました。コブノヒゲ属（Pogotrichum）をハバモドキ科（Punctariaceae）からアキネトスポラ科（Acinetosporaceae）に移しました。
＊3 Abbott & Hollenberg (1976) に従い，Ectocarpus socialisをFeldmannia cylindricaのシノニムとしました。Guiry & Guiry (2009) はF. cylindricaをF. simplexのシノニムとしています。
＊4 Silva et al. (1996)とGuiry & Guiry (2009) は，ナガミシオミドロ（Hincksia indica）をフェルドマニア属（Feldmannia）としています。
＊5 O'Kelly (1983) に従い，インテルノレティア属（Internoretia）を緑藻植物門（Chlorophyta），カエトフォラ目（Chaetophorales）から，黄藻植物門（Ochrophyta），シオミドロ目（Ectocarpales），シオミドロ科（Ectocarpaceae）に移しました。Silberfeld et al. (2014) に従い，本属をアキネトスポラ科のメンバーとしました。
＊6 Peters & Burkhardt (1998)，Peters & Ramirez (2001)，Cho et al. (2005) に従い，ニセモズク科（Acrotrichaceae），コモンブクロ科（Asperococcaceae），エゾフクロ科（Coilodesmaceae），ニセカヤモ科（Delamareaceae），ウイキョウモ科（Dictyosiphonaceae），ナミマクラ科（Elachistaceae），ネバリモ科（Leathesiaceae），ミリオネマ科（Myrionemataceae），ハバモドキ科（Punctariaceae），イソブドウ科（Sorocarpaceae），モズク科（Spermatochnaceae），ヨコジマノリ科（Striariaceae）をナガマツモ科（Chordariaceae）に含みました。ラミナリオコラックス属（Laminariocolax），ラミナリオネマ属（Laminarionema），ヤドリミドロ属（Streblonema）をシオミドロ科（Ectocarpaceae）からナガマツモ科に移しました。いくつかの科，属については更なる分類学的検討が必要と考えられます。
＊7 Silva et al. (1996) に従い，Myrionema orbiculareをAscocyclus属に移しました。
＊8 Guiry & Guiry (2009) は，Dictyosiphon corymbosusをD. foeniculaceusのシノニムとしています。
＊9 Norris (2010) に従い，Compsonema nummuloidesとCompsonema secundum f. terminaleをHecatonema streblonematoidesのシノニムとしました。C. nummuloidesの和名だった「モクノハリモ」を本種の和名としました。
＊10 川井・徳山（1996）に従い，Laminarionema elsbetiae の和名をコンブノイトとしました。
＊11 Pedroche et al. (2008) に従い，Leathesia difformisをL. marinaのシノニムとしました。
＊12 Noda (1987) に従い，Microspongium globosum Reinkeの和名をマルガタミリオネマとしました。
＊13 上井ら（1999）によると，Myriactula clavataはナミマクラ属（Elachista）と考えられます。
＊14 吉田（1998）によると，本種は国際植物命名規約（現 国際藻類・菌類・植物命名規約（ICN））において非正式名（invalid name）です。
＊15 Tanaka et al. (2010) はヒメネバリモ属（Phaeophysema）を設立し，ヒナネバリモ（Leathesia pulvinata）とヒメネバリモ（L. sphaeocephala）をネバリモ属（Leathesia）から移しました。
＊16 Kornmann & Sahling (1988) は，本種をキタシオミドロ属（Polytretus）からイソブドウ属（Botrytella）に移しましたが，Taskin & Pedersen (2012) はキタシオミドロ属を再評価することを提唱しています。
＊17 Y.-P. Lee & Garbary (2000) とE.-Y. Lee et al. (2002) に従い，ヒルナミマクラ（Elachista taeniaeformis）をナミマクラ属（Elachista）からProselachista属に移しました。本リストでは，Proselachista属の和名をヒルナミマクラ属としました。
＊18 吉田（1998）によると，本種は国際植物命名規約（現 国際藻類・菌類・植物命名規約（ICN））において非正式名（invalid name）です。
＊19 Tanaka et al. (2010) はコゴメネバリモ属（Vimineoleathesia）を設立し，コゴメネバリモ（Leathesia japonica）をネバリモ属（Leathesia）から移しました。Silberfeld et al. (2014)は，Tanaka et al. (2010) の分子系統解析において，コゴメネバリモがイソブドウ属（Botrytella）のクレードに含まれることから，本属の単系統性を疑問視しています。
＊20 Silva et al. (1996) はEctocarpus arctusをE. siliculosus f. arctusのシノニムとしています。また，Guiry & Guiry (2009) はE. siliculosus f. arctusをE. siliculosusのシノニムとしています。
＊21 Silberfeld et al. (2014) に従い，カギシオミドロ属（Spongonema）をナガマツモ科（Chordariaceae）からシオミドロ科（Ectocarpaceae）に移しました。
＊22 Racault et al. (2009) に従い，シワノカワ属（Petrospongium）をネバリモ科（Leathesiaceae）からシワノカワ科（Petrospongiaceae）に移しました。
＊23 Peters & Ramirez (2001)，Cho et al. (2006) に従い，ムラチドリ属（Chnoospora）をムラチドリ科（Chnoosporaceae）からカヤモノリ科（Scytosiphonaceae）に移しました。
＊24 Norris (2010) に従い，コンプソネマ属（Compsonema）をミリオネマ科（Myrionemataceae）からカヤモノリ科（Scytosiphonaceae）に移しました。
＊25 Silberfeld et al. (2014) に従い，キタイワヒゲ属（Melanosiphon）をナガマツモ科（Chordariaceae）からカヤモノリ科（Scytosiphonaceae）に移しました。
＊26 Matsumoto et al. (2014) はキヌハバノリ（Petalonia tenuis）を記載しました。
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