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本リストは，吉田・吉永 (2010) を基に北山・鈴木が改変したものです (2015.3.31)。主な変更点は番号をつけ，リストのあとに列記しました。吉田・鈴木・吉永 (2015) を参考に修正を行いました (2017.12.24)。
＊1 Park & Lee (1998) は，Champia bifidaをC. compressaのシノニムとしましたが，Suzuki (2008)によるとC. bifidaの体構造とrbcL遺伝子はC. compressaとは異なっています。
＊2 Suzuki et al. (2013) はナンブワツナギソウ（Champia lubrica）を記載しました。
＊3 Suzuki et al. (2013) によると，太平洋西岸で報告されているChampia parvulaは大西洋のものとは別種と考えられます。タイプ産地のC. parvulaとの比較検討が待たれています。
＊4 Le Gall et al. (2008) に従い，ニセイバラノリ属（Coelothrix）をマサゴシバリ科（Rhodymeniaceae）からワツナギソウ科（Champiaceae）に移しました。
＊5 Rodriguez-Prieto (2007) に従い，マダラグサ属（Fauchea）をGloiocladia属のシノニムとし，本リストでは，Gloiocladia属の和名をマダラグサ属としました。しかし，トゲマダラ（G. spinulosa）はヒシブクロ属（Gloioderma）の特徴を持ち，エツキマダラ（G. stipitata）はマサゴシバリ科（Rhodymeniaceae）に所属すべきと考えられるため，これら2種の属の再検討が必要です。
＊6 R. E. Norris (1991) は，Gloioderma属をGloiocladia属のシノニムとしましたが，Rodriguez-Prieto (2007)に従い，独立の属としました。
＊7 Suzuki et al (2012)はトゲナシマダラ（Gloiocladia leptophylla）をヒシブクロ属（Gloiocladia）からLeptofauchea属に移しました。Leptofauchea属の和名はトゲナシマダラ属としました。
＊8 Suzuki et al. (2010) はヘイゴコロ（Leptofauchea rhodymenioides）を日本新産種として報告しました。
＊9 R. Norris (1987) とLe Gall et al. (2008) に従い，テングサモドキ属（Gelidiopsis）をカイメンソウ属（Ceratodictyon）のシノニムとしました。
＊10 R. E. Norris (1987) とSilva et al. (1996) に従い，Gelidiopsis gracilisをCeratodictyon variabileのシノニムとしました。
＊11 Suzuki et al. (2009) に従い，ヒロハフシツナギ(Lomentaria okamurae)をヒメフシツナギ(L. pinnata) のシノニムとし，和名をヒロハフシツナギとしました。
＊12 Feldmann (1945) はBotryocladia kuckuckiiをB. skottsbergiiのシノニムとしましたが，Litter & Litter (2003) に従い，独立した種としました。また，台湾で採集したB. kuckuckiiのrbcL遺伝子の配列は，タイプ産地のB. skottsbergiiとは異なっています（鈴木）。
＊13 Ballantine et al. (2010) に従い，スジコノリ属（Chamaebotrys）の所属をマサゴシバリ科（Rhodymeniaceae）としましたが，スジコノリ属のタイプ種であるC. boergeseniiを含めた分類学的検討が必要です。
＊14 Saunders et al. (1999, 2006, 2007)，Suzuki (2008) によると，タオヤギソウ（Chrysymenia wrightii）は，タオヤギソウ属（Chrysymenia）とは異なる属と考えられます。Abbott & Littler (1969) はヒラタオヤギ属（Cryptarachne）をタオヤギソウ属のシノニムとしましたが，タオヤギソウ属は単系統群にはならず，ハナノエダ属（Botryocladia）と共に複合クレードを形成することから，ハナノエダ属，タオヤギソウ属，ヒラタオヤギ属のタイプ種を基にした分類学的検討が必要です。
＊15 Huisman (1996)によると，フクロツナギ（Coelarthrum opuntia）は，タイプ産地のC. opuntiaとは別種であり，分類学的検討が必要です。
＊16 Saunders et al. (2006) とBallantine et al. (2007) に従い，チリボタン属（Halichrysis）をマダラグサ科（Faucheaceae）からマサゴシバリ科（Rhodymeniaceae）に移しました。
＊17 Schneider et al.（2012）は，カサネイツツギヌをマサゴシバリ属（Rhodymenia）からHalopeltis属に移しました。Halopeltis属の和名はカサネイツツギヌ属としました。
＊18 R. E. Norris & Aken (1985) は，ハナガサネ（Rhodymenia coacta）をLeptofauchea anastomosans （現Asteromenia anastomosans）のシノニムとしています。
＊19 Abbott & Hollenberg (1976) とMillar (2001) に従い，ヒメヒシガタノリ（Fauchea rhizophylla）をSciadophycus stellatusのシノニムとしました。本リストではSciadophycus属の和名をヒメヒシガタノリ属としました。ヒメヒシガタノリ属は，マダラグサ科（Faucheaceae），Hymenocladiaceae，マサゴシバリ科（Rhodymeniaceae）のいずれかに属すると考えていますが，更なる分類学的検討が必要であり，本リストでは位置不明としました。
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